Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCO2O43819 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCO2O43819 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCO2O43819 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCO2O43819 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCO2O43819 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCO2O43819 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCO2O43819 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCO2O43819 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCO2O43819 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCO2O43819 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCO2O43819 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCO2O43819 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCO2O43819 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCO2O43819 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCO2O43819 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCO2O43819 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCO2O43819 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SCO2O43819 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCO2O43819 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCO2O43819 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCO2O43819 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCO2O43819 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCO2O43819 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCO2O43819 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCO2O43819 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCO2O43819 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SCO2O43819 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCO2O43819 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCO2O43819 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCO2O43819 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCO2O43819 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCO2O43819 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCO2O43819 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCO2O43819 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCO2O43819 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SCO2O43819 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCO2O43819 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCO2O43819 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCO2O43819 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCO2O43819 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCO2O43819 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCO2O43819 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCO2O43819 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCO2O43819 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCO2O43819 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCO2O43819 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCO2O43819 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCO2O43819 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCO2O43819 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCO2O43819 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCO2O43819 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCO2O43819 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCO2O43819 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCO2O43819 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCO2O43819 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCO2O43819 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCO2O43819 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCO2O43819 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCO2O43819 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCO2O43819 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCO2O43819 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCO2O43819 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCO2O43819 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCO2O43819 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCO2O43819 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCO2O43819 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCO2O43819 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCO2O43819 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SCO2O43819 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCO2O43819 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCO2O43819 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCO2O43819 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCO2O43819 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCO2O43819 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCO2O43819 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCO2O43819 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCO2O43819 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCO2O43819 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCO2O43819 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SCO2O43819 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCO2O43819 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCO2O43819 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SCO2O43819 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCO2O43819 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCO2O43819 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SCO2O43819 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SCO2O43819 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCO2O43819 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCO2O43819 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SCO2O43819 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCO2O43819 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCO2O43819 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCO2O43819 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCO2O43819 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCO2O43819 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCO2O43819 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SCO2O43819 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCO2O43819 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCO2O43819 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms