Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC7A4O43246 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC7A4O43246 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC7A4O43246 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC7A4O43246 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC7A4O43246 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC7A4O43246 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC7A4O43246 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC7A4O43246 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC7A4O43246 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC7A4O43246 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC7A4O43246 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC7A4O43246 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC7A4O43246 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC7A4O43246 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC7A4O43246 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC7A4O43246 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC7A4O43246 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC7A4O43246 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC7A4O43246 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC7A4O43246 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC7A4O43246 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC7A4O43246 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC7A4O43246 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC7A4O43246 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC7A4O43246 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC7A4O43246 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC7A4O43246 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC7A4O43246 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC7A4O43246 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC7A4O43246 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC7A4O43246 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC7A4O43246 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC7A4O43246 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC7A4O43246 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC7A4O43246 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC7A4O43246 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC7A4O43246 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms