Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM6BO15054 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM6BO15054 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM6BO15054 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM6BO15054 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM6BO15054 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM6BO15054 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM6BO15054 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM6BO15054 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM6BO15054 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM6BO15054 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM6BO15054 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM6BO15054 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM6BO15054 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM6BO15054 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM6BO15054 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM6BO15054 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM6BO15054 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM6BO15054 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM6BO15054 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM6BO15054 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM6BO15054 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM6BO15054 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM6BO15054 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM6BO15054 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM6BO15054 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM6BO15054 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM6BO15054 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM6BO15054 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM6BO15054 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM6BO15054 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM6BO15054 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM6BO15054 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM6BO15054 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM6BO15054 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM6BO15054 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM6BO15054 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM6BO15054 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM6BO15054 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM6BO15054 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM6BO15054 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM6BO15054 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM6BO15054 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM6BO15054 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM6BO15054 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM6BO15054 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM6BO15054 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM6BO15054 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms