Protein–RNA interactions for Protein: O14562

UBFD1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBFD1O14562 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms