Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms