Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms