Protein–RNA interactions for Protein: B7ZW38

HNRNPCL3, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL3B7ZW38 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HNRNPCL3B7ZW38 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms