Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4E171 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4E171 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4E171 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4E171 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
B4E171 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4E171 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4E171 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4E171 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
B4E171 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4E171 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
B4E171 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4E171 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
B4E171 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4E171 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
B4E171 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4E171 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4E171 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4E171 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4E171 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4E171 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4E171 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4E171 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4E171 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
B4E171 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
B4E171 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4E171 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4E171 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4E171 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4E171 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4E171 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4E171 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4E171 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4E171 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4E171 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B4E171 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4E171 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4E171 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4E171 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4E171 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
B4E171 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4E171 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4E171 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4E171 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4E171 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4E171 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4E171 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4E171 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4E171 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4E171 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4E171 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4E171 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4E171 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
B4E171 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4E171 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4E171 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4E171 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
B4E171 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4E171 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4E171 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4E171 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4E171 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4E171 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4E171 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4E171 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4E171 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4E171 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4E171 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
B4E171 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
B4E171 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4E171 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4E171 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4E171 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4E171 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4E171 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4E171 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4E171 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4E171 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4E171 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4E171 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4E171 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4E171 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4E171 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4E171 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4E171 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4E171 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4E171 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4E171 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4E171 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4E171 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4E171 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4E171 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4E171 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
B4E171 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
B4E171 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4E171 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4E171 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4E171 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4E171 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
B4E171 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms