Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NL46 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NL46 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NL46 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NL46 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NL46 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NL46 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NL46 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NL46 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NL46 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NL46 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NL46 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NL46 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NL46 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NL46 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NL46 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NL46 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NL46 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NL46 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NL46 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NL46 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NL46 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NL46 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NL46 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NL46 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NL46 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NL46 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NL46 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NL46 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NL46 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NL46 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NL46 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NL46 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NL46 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NL46 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NL46 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NL46 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NL46 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NL46 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NL46 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NL46 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NL46 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NL46 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NL46 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NL46 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NL46 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NL46 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NL46 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NL46 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NL46 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NL46 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NL46 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NL46 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NL46 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NL46 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NL46 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NL46 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NL46 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NL46 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NL46 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NL46 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NL46 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NL46 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NL46 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NL46 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NL46 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NL46 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NL46 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NL46 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NL46 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NL46 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NL46 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NL46 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NL46 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NL46 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NL46 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NL46 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NL46 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NL46 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NL46 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NL46 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NL46 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NL46 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NL46 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
A6NL46 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
A6NL46 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
A6NL46 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
A6NL46 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
A6NL46 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
A6NL46 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
A6NL46 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
A6NL46 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
A6NL46 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
A6NL46 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.8 ms