Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms