Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms