Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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