Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms