Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms