Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GIT1Q9Y2X7 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms