Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I6

NINL, Ninein-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINLQ9Y2I6 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NINLQ9Y2I6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NINLQ9Y2I6 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NINLQ9Y2I6 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NINLQ9Y2I6 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NINLQ9Y2I6 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NINLQ9Y2I6 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NINLQ9Y2I6 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NINLQ9Y2I6 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NINLQ9Y2I6 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NINLQ9Y2I6 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NINLQ9Y2I6 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NINLQ9Y2I6 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NINLQ9Y2I6 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NINLQ9Y2I6 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NINLQ9Y2I6 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NINLQ9Y2I6 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NINLQ9Y2I6 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NINLQ9Y2I6 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NINLQ9Y2I6 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NINLQ9Y2I6 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NINLQ9Y2I6 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NINLQ9Y2I6 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NINLQ9Y2I6 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NINLQ9Y2I6 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NINLQ9Y2I6 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NINLQ9Y2I6 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms