Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms