Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms