Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms