Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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