Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms