Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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HOXC10Q9NYD6 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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HOXC10Q9NYD6 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
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HOXC10Q9NYD6 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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HOXC10Q9NYD6 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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