Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms