Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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FANCFQ9NPI8 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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