Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms