Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP50

FAM60A, Protein FAM60A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM60AQ9NP50 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM60AQ9NP50 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms