Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms