Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms