Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms