Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms