Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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FOXQ1Q9C009 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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FOXQ1Q9C009 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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FOXQ1Q9C009 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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FOXQ1Q9C009 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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FOXQ1Q9C009 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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FOXQ1Q9C009 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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