Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms