Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF3

CECR2, Cat eye syndrome critical region protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CECR2Q9BXF3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CECR2Q9BXF3 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CECR2Q9BXF3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CECR2Q9BXF3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CECR2Q9BXF3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CECR2Q9BXF3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CECR2Q9BXF3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CECR2Q9BXF3 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CECR2Q9BXF3 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CECR2Q9BXF3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CECR2Q9BXF3 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CECR2Q9BXF3 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CECR2Q9BXF3 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CECR2Q9BXF3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CECR2Q9BXF3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CECR2Q9BXF3 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CECR2Q9BXF3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CECR2Q9BXF3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CECR2Q9BXF3 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CECR2Q9BXF3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CECR2Q9BXF3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CECR2Q9BXF3 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CECR2Q9BXF3 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CECR2Q9BXF3 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CECR2Q9BXF3 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CECR2Q9BXF3 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CECR2Q9BXF3 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CECR2Q9BXF3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CECR2Q9BXF3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CECR2Q9BXF3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CECR2Q9BXF3 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CECR2Q9BXF3 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CECR2Q9BXF3 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CECR2Q9BXF3 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CECR2Q9BXF3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CECR2Q9BXF3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CECR2Q9BXF3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CECR2Q9BXF3 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CECR2Q9BXF3 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
CECR2Q9BXF3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CECR2Q9BXF3 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CECR2Q9BXF3 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms