Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms