Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms