Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC17Q96LX7 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC17Q96LX7 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms