Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms