Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ULK4Q96C45 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms