Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG2BQ96BY7 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms