Protein–RNA interactions for Protein: Q969E4

TCEAL3, Transcription elongation factor A protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEAL3Q969E4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCEAL3Q969E4 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCEAL3Q969E4 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEAL3Q969E4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEAL3Q969E4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEAL3Q969E4 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEAL3Q969E4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEAL3Q969E4 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEAL3Q969E4 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEAL3Q969E4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEAL3Q969E4 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEAL3Q969E4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEAL3Q969E4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEAL3Q969E4 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEAL3Q969E4 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEAL3Q969E4 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEAL3Q969E4 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEAL3Q969E4 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEAL3Q969E4 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEAL3Q969E4 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEAL3Q969E4 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEAL3Q969E4 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEAL3Q969E4 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEAL3Q969E4 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEAL3Q969E4 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEAL3Q969E4 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEAL3Q969E4 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEAL3Q969E4 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEAL3Q969E4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEAL3Q969E4 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEAL3Q969E4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEAL3Q969E4 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEAL3Q969E4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEAL3Q969E4 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEAL3Q969E4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEAL3Q969E4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEAL3Q969E4 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEAL3Q969E4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEAL3Q969E4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEAL3Q969E4 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCEAL3Q969E4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCEAL3Q969E4 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCEAL3Q969E4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCEAL3Q969E4 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCEAL3Q969E4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCEAL3Q969E4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCEAL3Q969E4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCEAL3Q969E4 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCEAL3Q969E4 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCEAL3Q969E4 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEAL3Q969E4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEAL3Q969E4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEAL3Q969E4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEAL3Q969E4 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEAL3Q969E4 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEAL3Q969E4 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEAL3Q969E4 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEAL3Q969E4 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEAL3Q969E4 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEAL3Q969E4 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEAL3Q969E4 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEAL3Q969E4 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEAL3Q969E4 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEAL3Q969E4 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEAL3Q969E4 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEAL3Q969E4 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEAL3Q969E4 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEAL3Q969E4 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEAL3Q969E4 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEAL3Q969E4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEAL3Q969E4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEAL3Q969E4 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEAL3Q969E4 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEAL3Q969E4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEAL3Q969E4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEAL3Q969E4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEAL3Q969E4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEAL3Q969E4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEAL3Q969E4 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEAL3Q969E4 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEAL3Q969E4 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEAL3Q969E4 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEAL3Q969E4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEAL3Q969E4 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEAL3Q969E4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEAL3Q969E4 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEAL3Q969E4 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEAL3Q969E4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEAL3Q969E4 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEAL3Q969E4 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEAL3Q969E4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEAL3Q969E4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEAL3Q969E4 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEAL3Q969E4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEAL3Q969E4 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEAL3Q969E4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEAL3Q969E4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEAL3Q969E4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEAL3Q969E4 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEAL3Q969E4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms