Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MCOLN3Q8TDD5 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms