Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBW4

SLC38A9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A9Q8NBW4 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms