Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms