Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms