Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSK4Q6SA08 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms