Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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C9orf135Q5VTT2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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