Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms