Protein–RNA interactions for Protein: Q5FBB7

SGO1, Shugoshin 1, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO1Q5FBB7 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGO1Q5FBB7 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGO1Q5FBB7 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGO1Q5FBB7 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGO1Q5FBB7 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGO1Q5FBB7 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGO1Q5FBB7 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGO1Q5FBB7 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SGO1Q5FBB7 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGO1Q5FBB7 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGO1Q5FBB7 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGO1Q5FBB7 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGO1Q5FBB7 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SGO1Q5FBB7 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SGO1Q5FBB7 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGO1Q5FBB7 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SGO1Q5FBB7 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGO1Q5FBB7 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SGO1Q5FBB7 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGO1Q5FBB7 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGO1Q5FBB7 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SGO1Q5FBB7 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGO1Q5FBB7 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SGO1Q5FBB7 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SGO1Q5FBB7 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGO1Q5FBB7 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGO1Q5FBB7 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGO1Q5FBB7 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SGO1Q5FBB7 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGO1Q5FBB7 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGO1Q5FBB7 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGO1Q5FBB7 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGO1Q5FBB7 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGO1Q5FBB7 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGO1Q5FBB7 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGO1Q5FBB7 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGO1Q5FBB7 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGO1Q5FBB7 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGO1Q5FBB7 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGO1Q5FBB7 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGO1Q5FBB7 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGO1Q5FBB7 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
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SGO1Q5FBB7 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGO1Q5FBB7 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGO1Q5FBB7 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGO1Q5FBB7 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGO1Q5FBB7 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGO1Q5FBB7 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGO1Q5FBB7 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGO1Q5FBB7 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGO1Q5FBB7 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGO1Q5FBB7 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGO1Q5FBB7 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGO1Q5FBB7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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SGO1Q5FBB7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGO1Q5FBB7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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SGO1Q5FBB7 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGO1Q5FBB7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGO1Q5FBB7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGO1Q5FBB7 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGO1Q5FBB7 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGO1Q5FBB7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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SGO1Q5FBB7 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGO1Q5FBB7 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGO1Q5FBB7 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGO1Q5FBB7 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGO1Q5FBB7 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGO1Q5FBB7 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGO1Q5FBB7 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGO1Q5FBB7 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGO1Q5FBB7 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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SGO1Q5FBB7 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGO1Q5FBB7 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGO1Q5FBB7 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SGO1Q5FBB7 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGO1Q5FBB7 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGO1Q5FBB7 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGO1Q5FBB7 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGO1Q5FBB7 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGO1Q5FBB7 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGO1Q5FBB7 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGO1Q5FBB7 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGO1Q5FBB7 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGO1Q5FBB7 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGO1Q5FBB7 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGO1Q5FBB7 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGO1Q5FBB7 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGO1Q5FBB7 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGO1Q5FBB7 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGO1Q5FBB7 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGO1Q5FBB7 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGO1Q5FBB7 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGO1Q5FBB7 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SGO1Q5FBB7 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGO1Q5FBB7 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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