Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms