Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 CRHR1-206ENST00000398285 2399 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 AC092723.2-201ENST00000624955 793 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 DNAJC24-202ENST00000465995 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 OTOA-203ENST00000388957 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms